Interactions Bactéries Probiotiques-Hôte (IBPH)

Notre équipe travaille sur la thématique probiotiques-prébiotiques, microbiota intestinale et sante de l’hôte tant dans son volet recherche fondamentale que de développement industriel en collaboration avec des entreprisses. Nous effectuons la sélection des souches potentiellement probiotiques, étant un des critères de sélection la production de substances antimicrobiennes capables d’inhiber des pathogènes (bactéries et fungi). Nous étudions l’innocuité des souches et son mode d’action en accentuant les recherches sur des études in vivo et sur l’axe immunomodulation avec la recherche des souches aux propriétés anti-inflammatoires. Un intérêt accru a été donné à la caractérisation des constituants bactériens potentiellement impliqués dans l’effet bénéfique, comme les substances antimicrobiennes (SA). Les SA issues des bactéries probiotiques sont caractérisées par la mise au point de nouvelles méthodes analytiques axées sur la spectrométrie de masse. La recherche et l’analyse fonctionnelle des déterminants génétiques impliqués dans la synthèse de SA est effectuée. Notre recherche sur les SA nous a amené à la découverte d’un nouveau lantibiotique (bactériocine de classe I) qui a fait l’objet d’une prise de brevet. Nous étudions aussi in vivo l’impact des souches probiotiques productrices de bactériocines ou d’autres SA sur le microbiote intestinal de l’hôte en utilisant des méthodes moléculaires d’analyse du microbiome. Nous sommes aussi intéressés dans l’étude et la caractérisation des protéines secrétés par des probiotiques et qui peuvent avoir une fonction de médiateurs dans la réponse avec les cellules de l’hôte. Ainsi récemment on a découvert une nouvelle famille de peptides immunomodulateurs que sont encryptés dans la séquence de certaines protéines secrétés par des Lactobacillus et qui ne peuvent pas être digérés par les protéases secrétées par l’hôte, les peptides ST. Un de ses peptides a démontré des activités antiinflammatoires sur des cellules dendritiques intestinales purifiées à partir des personnes souffrant de la maladie de Crohn.