Ecologie &Biologie des Interactions

Les activités de l’équipe de Microbiologie de l’Eau sont dirigées vers la maitrise et le contrôle de Legionella dans les réseaux d’eau. Cette action se traduit par la recherche, l’isolement et la caractérisation de molécules anti- Legionella au premier rang desquelles figurent les peptides produits par des staphylocoques. Le mode d’action de ces peptides et la recherche de leur mode d’action par utilisation de variants de peptides non-hémolytiques constituent un axe important de recherche. L’activité anti-cancéreuse, en particulier anti-leucémique, de ces peptides anti-Legionella a été récemment caractérisée. Par microspectroscopie RAMAN, il a été montré que ces peptides avaient une activité membranolytique.

Nous avons récemment élargi notre recherche de nouvelles molécules anti-Legionella en nous concentrant sur celles produites par des bactéries de l’eau. Nous avons ainsi purifié et caractérisé des lipopeptides produits par des Bacillus et des Pseudomonas actifs contre ce pathogène.

Un second axe important de recherche porte sur la fonctionnalisation de surfaces par greffage, covalent ou non, de molécules antimicrobiennes, dont des peptides. Cette fonctionnalisation est étudiée afin d’essayer d’obtenir des systèmes stables pour l’élaboration de matériaux, biomédicaux en particulier, à activité anti-biofilm.

L’équipe Ecologie Evolution Symbiose s’intéresse plus particulièrement aux interactions hôtes/pathogènes avec comme modèle phare, l’isopode terrestre Armadillidium vulgare, communément appelé cloporte. Les cellules immunitaires (hémocytes) d’Armadillidium vulgare produisent un peptide immunitaire appelé armadillidine dont nous avons montré qu’il existe deux isoformes ayant toutes deux un spectre large d’activité antibactérienne et antifongique. De façon surprenante, ce peptide ne semble pas présenter de structure secondaire, y compris dans des milieux mimant les membranes, ceci en raison de sa séquence très riche en glycines.