BiosCiences
Parmi les axes de recherches du groupe, l’étude des PAM issus de micro-organismes (bactéries intestinales commensales de l’homme) représente un axe majeur. Nous développons également des études qui utilisent des PAM humains à activité immunomodulatrice (défensines et LL-37) ainsi que des PAM d’origine animale (PAM de venins notamment). Ainsi, le laboratoire a décrit des bactériocines RumA et C produites par la bactérie commensale Gram + Ruminococcus gnavus E1 avec une activité antiClostridium. La caractérisation structurale et la production in silico d’analogues et de mimétiques (synthèse et cyclisation chimique et expression hétérologue) du PAM RumC est en cours. Les travaux sur les PAM bactériens nous ont amené également à étudier le cross-talk entre espèces bactériennes commensales Gram(-) et Gram(+) responsables de leurs productions. Outre la caractérisation de l’activité antimicrobienne, anticancer et anti-inflammatoire de ces PAM d’origines diverses, nous étudions leurs mécanismes d’interactions avec les membranes biologiques des eucaryotes et procaryotes (monocouche, bicouche, liposomes). En utilisant les outils de biologie moléculaire (mutagénèse), de biochimie (caractérisation), de biophysique (tensiomètrie) et de chimie (synthèse, modification, cyclisation), nous avons pour objectifs :
1/ d’améliorer l’efficacité de ces molécules, 2/ de leurs conférer des propriétés nouvelles, 3/ d’améliorer leurs biodisponibilité (en terme d’absorption, de demi-vie, de tolérance/innocuité chez l’humain), 4/ de comprendre leur mécanisme d’action. L’obtention de PAM chimériques (PAM bactérien/bactérien, bactérien/humain, humain/humain) peut être une approche nouvelle.
Equipe « BiosCiences»
Resp. de l’équipe : Dr.Thierry TRON
Correspondant GDR : Pr.Josette PERRIER, josette.perrier@univ-amu.fr
Adresse complète
Aix-Marseille Université – Centre de St Jérôme, Service 342 13397 Marseille Cedex 20 |
Code unité
UMR-CNRS 7313 |
Tutelle(s)
CNRS-AMU |
Adresse internet du laboratoire ou institut
http://ism2.univ-amu.fr/fr/biosciences/les-thematiques-de-biosciences
Effect of Bacillus subtilis Strains on Intestinal Barrier Function and Inflammatory Response
Aurone derivatives as promising antibacterial agents against resistant Gram-positive pathogens
Anti-Staphylococcal Enterotoxinogenesis of Lactococcus lactis in Algerian Raw Milk Cheese
The rumen microbiome: an underexplored resource for novel antimicrobial discovery
Radical Copolymerization of Vinyl Ethers and Cyclic Ketene Acetals as a Versatile Platform to Design Functional Polyesters
Ruminococcin C, a new anti-Clostridium perfringens bacteriocin produced in the gut by the commensal bacterium Ruminococcus gnavus E1
Characterization and distribution of the gene cluster encoding RumC, an anti Clostridium perfringens bacteriocin produced in the gut
Biophysical studies of the interaction of squalamine and other cationic amphiphilic molecules with bacterial and eukaryotic membranes. Importance of the distribution coefficient in membrane selectivity.
Production of an antibacterial substance in the digestive tract involved in colonization-resistance against Clostridium perfringens
Ruminococcus gnavus E1 modulates mucin expression and intestinal glycosylation
Production : Identification, Biosynthèse, Expression hétérologue, Synthèse chimique, Purification
Etudes Structurales et mécanistiques : Microscopie à fluorescence, Microscopie confocale, Microscopie électronique, Modélisation moléculaire, Modélisation par homologie & docking, Biologie structurale RMN, Relation structure-activité.
Optimisation moléculaire : Bioinformatique, Mutagénèse aléatoire, Mutagénèse dirigée, Relations structure- activité
Interaction PAM- membrane : Monocouches, Bicouches, Micelles, Bicelles, Liposomes (SUV, LUV,…), Perméabilité membranaire & Analyse des flux
Test Biologiques : Tests antibactériens, Tests d’activité immunomodulatrice, Test de toxicité.
PAM et thérapeutique : PAM et résistance, Synergie PAM/PAM, Synergie PAM/antibiotiques conventionnels, Vectorisation, PAM chimériques
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